La Lignina es un heteropolímero de origen vegetal cuya ruta se degradación es de gran interés en biotecnología debido a que el sistema enzimático implicado a la degradación de materia orgánica compuesto aromático y el blanqueamiento de papel entre otras aplicaciones. El objetivo de este trabajo fue obtener aislamientos nativos de hongos lignolíticos deuteromyceltes a partir de muestras de suelo de sabana inundable provenientes de diferentes uso agrícolas. Veinticinco morfoticos provenientes a los géneros verticillun, penecilium, fusarium, zygorhynchus y Mucor, capaces de crecer de Lignina como sustrato selectivo fueron aislados, no se encontró una relación entre el uso agrícola, el número de hongos lignolíticos y su actividad enzimático. Los resultados obtenidos en este estudio muestra una actividad peroxidasa para trichoderma viride de 18 por ciento con respecto al control (pleurolas ostreatus) y de un a 7 a 14 por ciento para las morfotipos nativos de verticillium aislados, la degradación de materia orgánica y compostaje, debido a su adaptación a las condiciones ambientales de las Sabanas de los Llanos Orientales Colombianos.